学院导师

朱通

2025.10.02阅读量:10

学院导师

朱通

上海创智学院全时导师

华东师范大学教授

领域方向:AI基础理论与科学智能

致力于融合 AI 和物理模型探索复杂体系原子级化学反应机理,实现对生物和能源等领域关键反应的精确调控。从事分子反应 动力学、大分子量子化学计算和生物分子模拟的研究十余年的时间发展了一种神经网络力场方法(NN/MM-RESP)实现了 Zn 离子水合的精确模拟(J. Phys. Chem. A. 2019, 123, 6587)。该模型的精度与量子化学计算相当,但效率提高了三个数量级以 上,从而实现了 Zn 离子水合的纳秒级模拟,模拟结果和实验高度吻合,明显好于传统分 子力场。合作者曾基于 MFCC 及其衍生模型,实现了蛋白质的从头算动力学模拟(AIMD, J. Chem. Theory Comput. 2015, 11, 5897.; Front. Chem. 2018, 6, 189.)。最近他基 于 MFCC 发展了可以对金属蛋白进行 AIMD 模拟的新方法 Metal-MFCC,该方法可以在量子 水平上精确的处理金属离子与蛋白质的相互作用(J. Chem. Theory Comput. 2019, 15, 1430.)。通过引入电荷转移效应成功的发展了一种可以对含锌蛋白质进行精确处理的力场QPCT (J. Chem. Theory Comput. 2013, 9, 1788.)。同合作者一起研究了 PI4KIII-alpha蛋白及相关的膜蛋白复合体在治疗阿尔兹海默病中的应用。相关研究已经申请了国际专利(专利号:WO2016173562A1.)。基于自由能微扰和增强采样模拟研究了 Guanine Riboswitch与配体的相互作用以及构象动力学性质 (Nucleic Acids Res. 2019, 47, 6618)。研究了多种抑制剂对 PI4KIII-alpha 和 PI4KIII-beta 的选择性机制(Phys. Chem. Chem. Phys., 2019, 21, 22103-22112.)。开发了可对大规模反应动力学模拟轨迹进行 自动分析的软件 ReacNetGenerator(Phys. Chem. Chem. Phys., 2020, 22, 683),目前该软件已有上百次的下载量。到目前为止,在国内外学术期刊发表 SCI 论文 78 篇,开发多个算法,取得两项国际专利,一个 II 期临床新药,发表论文80余篇,引用2000余次